专著：

1．《明代知识界讲学活动系年：1522—1602》，学林出版社，2000年1月

2．《<传习录>精读》，复旦大学出版社，2000年1月

3．《阳明后学研究》，上海人民出版社，2003年4月

4．《泰州学派研究》，中国人民大学出版社，2009年11月

5．《罗汝芳评传》，南京大学出版社，2011年4月

6．《颜茂猷思想研究》，东方出版社，2015年9月

7．《当中国儒学遭遇日本》，华东师大出版社，2015年10月

8．《明末清初劝善运动思想研究》，上海人民出版社，2016年4月

9．《儒学思想十论：吴震学术论集》，孔学堂书局，2016年10月

10．《东亚儒学问题新探》，北京大学出版社，2017年12月

11．《中华传统文化百部经典·传习录》，国家图书馆出版社，2018年11月

12．《朱子思想再读》，生活·读书·新知三联书店，2019年3月

13．《宋明理学新视野》，商务印书馆，2021年4月

论文：

1．作为良知伦理学的“知行合一”论——以“一念动处便是知亦便是行”为中心[J].学术月刊，2018，50(05)：14-24

2．再论“两种阳明学”——近代日本阳明学的问题省思[J].社会科学战线，2018(07)：31-43+281

3．十年来宋明理学研究的回顾与展望——以朱子学和阳明学为中心[J].孔子研究，2018(04)：130-137

4．儒学历史及其未来发展的几点思考——以阳明学与东亚儒家伦理的问题为核心[J].孔子研究，2018(04)：11-16

5．从宋明理学视域看“浙学”的多元普遍性[J].浙江社会科学，2018(09)：104-109+158-159

6．东亚朱子学：中国哲学的丰富性展示[J].哲学动态，2019(01)：50-59

7．东亚朱子学研究的回顾与反思[J].杭州师范大学学报(社会科学版)，2019，41(01)：1-25

8．朱子思想研究如何回归文本与问题？——《朱子思想再读》自序[J].孔学堂，2019，6(01)：12-19+117-120+20-25

9．宋明理学视域中的朱子学与阳明学[J].哲学研究，2019(05)：67-75

10．论阳明学的良知实体化[J].学术月刊，2019，51(10)：14-21

11．朱子学理气论域中的“生生”观——以“理生气”问题为核心[J].清华大学学报(哲学社会科学版)，2019，34(06)：167-175+203

12．宋代新儒学与经典世界的重建[J].浙江社会科学，2019(11)：125-134+159-160

13．阳明学时代何以“异端”纷呈？——以杨慈湖在明代的重新出场为例[J].浙江社会科学，2020(01)：110-118+159

14．作为哲学方法论的“本来性—现实性”——就荒木见悟《佛教与儒教》而谈[J].中国哲学史，2020(01)：86-95

15．心学与气学的思想异动[J].复旦学报(社会科学版)，2020，62(01)：113-125

16.新“鹅湖之会”高端会讲——朱子学与阳明学的现代交锋[J].贵阳学院学报(社会科学版)，2020，15(01)：1-22

17.“名教罪人”抑或“启蒙英雄”?——李贽思想的重新定位[J].现代哲学，2020(03)：118-129

18.当代中国“家”文化的理论探索[J].杭州师范大学学报(社会科学版)，2020，42(06)：53-54

19.张载道学论纲[J].哲学研究，2020(12)：37-45+124

20．王阳明的良知学系统建构[J].学术月刊，2021，53(01)：11-22