专著：

1、《朱熹哲学研究》（中国社会科学出版社，1988）；

2、《朱子书信编年考证》（上海人民出版社，1989）；

3、《有无之境——王阳明哲学的精神》（人民出版社，1991）；

4、《宋明理学》（辽宁教育出版社，1992）；

5、《哲学与传统：现代儒家哲学与现代中国文化》（台湾允晨出版公司，1994）；

6、《古代宗教与伦理——儒家思想的根源》（三联书店，1996）；

7、《陈来自选集》（广西师范大学出版社，1997）；

8、《中国宋元明哲学史》（香港公开大学，1999）；

9、《朱子哲学研究》（华东师范大学出版社，2000）；

10、《现代中国哲学的追寻——新理学与新心学》（人民出版社，2001）；

11、《古代思想文化的世界》（三联书店，2002）；

12、《中国近世思想史研究》（商务印书馆，2003）；

13、《诠释与重建——王船山的哲学精神》（北京大学出版社，2004）；

14、《传统与现代：人文主义的视界》（北京大学出版社，2006）；

15、《朱子书信编年考证》（增订本）（三联书店，2007）；

16、《燕园问学记》（北京大学出版社，2008）；

17、《东亚儒学九论》（三联书店，2008）；

18、《宋明儒学论》（香港三联，2008）；

19、《竹帛五行与简帛研究》（三联书店，2009）；

20、《孔夫子与现代世界》，（北京大学出版社，2011）；

21、《回向传统——儒学的哲思》，（北京师范大学出版社，2011）；

22、《北京 国学 大学》，（北京大学出版社，2012）；

23、《竹简五行篇讲稿》，（三联书店，2012）；

24、《陈来儒学思想录》，（华东师大出版社，2014）；

25、《陈来讲谈录》，（九州出版社，2014）；

26、《仁学本体论》，（三联书店，2014）；

27、《理解与诠释》，（首都师范大学出版社，2015）；

28、《中华文明的核心价值：国学流变与传统价值观》，（三联书店，2015）；

29、《山高水长集》，（中华书局，2015）]；

30、《从思想世界到历史世界》，（北京大学出版社，2015）；

31、《儒学通诠——陈来学术论集》，（孔学堂书局，2015）；

32、《陈来儒学思想录》（修订版），（华东师范大学出版社，2016）；

33、《孔子·孟子·荀子》，（三联书店，2017）；

34、《近世东亚儒学研究》，（北京大学出版社，2018）； 

35、《守望传统的价值——陈来二十年访谈录》，（中华书局，2018）；

36、《冯友兰的伦理思想》，（三联书店，2018）。

另编有：

《中国现代学术经典——冯友兰卷》上下卷（河北教育出版社，1997）；

《北大哲学门经典文萃》十种（吉林人民出版社，2005）；

《早期道学话语的形成与演变》（安徽教育出版社，2007）等。